تتكون كلية التربية النوعية جامعة بنها من الأقسام الإدارية التالية:
- قسم شئون الطلاب.
- قسم الدراسات العليا.
- قسم رعاية الشباب.
- قسم التربية العملية.
- قسم متابعة الخريجين.
- قسم الاستحقاقات.
- قسم شئون العاملين.
- قسم شئون أعضاء هيئة التدريس.
- قسم المشتريات والمخازن.
- قسم المكتبة.
- قسم شئون مكتب العميد.